在進行工業(yè)化循環(huán)水養(yǎng)殖中，水質的凈化處理和循環(huán)利用是非常關鍵的一個環(huán)節(jié)。水質凈化中需要處理掉的一個有害物質那就是分子氨。

養(yǎng)殖水體中分子氨主要來源于沉入池底的飼料、排遺物、肥料和動植物遺骸。魚、蝦類的含氮排遺物中約80%～90%為分子氨，其含量的多少主要取決于排遺物中的蛋白質含量大小。

分子氨對魚蝦毒性是很強的，特別是在pH值高、水溫高的條件下其毒性更大。一般以0.05~0.1毫克／升的分子氨作為可允許的上限值。當水體中分子氨濃度過高時，會使魚蝦產生毒血癥，長期過高則將抑制它們的生長、繁殖，嚴重時出現魚蝦中毒甚至死亡現象，同時氨的氧化也會消耗水中大量的氧，導致水體缺氧。

分子級的氨和離子級的銨在水中可以互相轉化，轉化數量取決于池水pH值和水溫。

當pH值越小，水溫越低時，分子氨的比例相應越小，毒性就越低。當pH值<7時，總氨幾乎都是以銨離子形式存在；pH值越大，水溫越高，分子氨比例越大，毒性越強。所以要控制池水中氨，就需要有效控制其來源和pH值；控制好魚類的放養(yǎng)密度和單位水體載魚量。若出現氨過高時，可通過增加水中的溶解氧含量來進行預防。尤其是傳統(tǒng)池塘養(yǎng)殖，在夏季高溫時節(jié)尤其要注意。

工業(yè)化循環(huán)水養(yǎng)殖因為有了水質凈化系統(tǒng)，水質情況一般能夠得到保證，但也應注意要合理投餌，調節(jié)好水循環(huán)系統(tǒng)，做好水質的監(jiān)測和pH值檢測工作，消除氨氮等水質危害。